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太湖實驗室實行理事會領(lǐng)導(dǎo)下的主任負(fù)責(zé)制,，設(shè)有5個職能部門,，若干科研機(jī)構(gòu)，組織機(jī)構(gòu)圖如下：
深海技術(shù)科學(xué)太湖實驗室
組織機(jī)構(gòu)